Protein–ligand yanaştırma
Protein–ligand yanaştırma bir moleküler modelleme tekniğidir. Protein–ligand yanaştırmanın amacı, bir ligandın (küçük bir molekül) bir protein reseptörüne veya enzime bağlandığındaki konumunu ve oryantasyonunu tahmin etmektir. Farmasötik araştırma, çeşitli amaçlarla, özellikle de olası ilaç adaylarını seçmek için mevcut kimyasalların geniş veritabanlarının sanal taranmasında, yanaştırma tekniklerini kullanır.
AutoDock ve AutoDock Vina, rDock, FlexAID, Molecular Operating Environment ve Glide gibi proteinlerle etkileşen küçük moleküllerin veya peptitlerin yerini, geometrisini ve enerjisini hesaplayan birçok protein ligand yazılımı uygulaması mevcuttur.
Ayrıca bakınız
[değiştir | kaynağı değiştir]- Yanaştırma (moleküler)
- Protein–protein yanaştırma
- Sanal tarama
- Protein-ligand yanaştırma yazılımlarının listesi
Kaynakça
[değiştir | kaynağı değiştir]Dış bağlantılar
[değiştir | kaynağı değiştir]- BioLiP 22 Aralık 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi., kapsamlı bir ligand-protein etkileşim veritabanı