Holliday bağlantısı
Holliday bağlantısı dört DNA ipliği arasında oluşan hareketli bir bağlantıdır. 1964'te Robin Holliday, mayada gözlemlediği, homolog rekombinasyon olarak bilinen, bazı genetik bilgi değiştokuş biçimlerini açıklayabilmek için böyle bir yapı olması gerektiğini öne sürmüştü, bu yüzden bu moleküler yapıya onun adı verilmiştir.[1][2][3] Holliday bağlantıları prokaryotlardan memelilere kadar pek çok canlı türünde oluşur.[4]
Bu bağlantılar homolog diziler arasında oluştuğu için DNA boyunca ileri geri kayabilirler. Bakteriler bu kayma (dal ilerlemesi olarak da adlandırılır) RuvABC kompleksi veya RecG proteini tarafından kolaylaştırılır, bunlar ATP hidroliziyle açığa çıkan enerjiyi kullanan ve Holliday bağlantısını iten moleküler motorlardır. İki doğrusal DNA dupleksinin (ikilisini) yeniden oluşabilimesi için bağlantının ayrışması gerekir. Ayrışma olunca ya başlangıçtaki konfigürasyon tekrar oluşur veya DNA ipliklerinin karçılıklı yer değiştirdiği (krosover) yeni bir konfigürasyon oluşur. Homolog rekombinasyonda ayrışma ya yatay ya da dikey şekilli olur, meydan gelen ürünler ya "yama" ürünlerdir (eğer çift iplikli kırık tamiri sırasında aynı doğrultuda olursa) ya da "uç birleştirme" (İng. splice) ürünleridir (eğer çift iplikli kırık tamiri sırasında farklı doğrultuda olursa).
Holliday bağlantıları genetik rekombinasyonda ara ürünlerdir, genetik bütünlüğü muhafaza etmekte önemli bir rolleri vardır.[1][5]
Ayrıca bakınız
[değiştir | kaynağı değiştir]Kaynakça
[değiştir | kaynağı değiştir]- ^ a b Stahl FW (Ekim 1994). "The Holliday junction on its thirtieth anniversary". Genetics. 138 (2). ss. 241-246. PMID 7828807. 19 Ocak 2010 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi4 Aralık 2009.
- ^ Liu Y, West S (2004). "Happy Hollidays: 40th anniversary of the Holliday junction". Nat Rev Mol Cell Biol. 5 (11). ss. 937-44. doi:10.1038/nrm1502. PMID 15520813.
- ^ Hays FA, Watson J, Ho PS (2003). "Caution! DNA Crossing: Crystal Structures of Holliday Junctions". J Biol Chem. 278 (50). ss. 49663-49666. doi:10.1074/jbc.R300033200.
- ^ Constantinou A, Davies AA, West SC (2001). "Branch migration and Holliday junction resolution catalyzed by activities from mammalian cells". CELL. 104 (2). ss. 259-268. doi:10.1016/S0092-8674(01)00210-0. PMID 11207366.
- ^ Fu TJ, Tse-Dinh YC, Seeman NC (1994). "Holliday junction crossover topology". J. Mol. Biol. 236 (1). ss. 91-105. doi:10.1006/jmbi.1994.1121. PMID 8107128.
Dış bağlantılar
[değiştir | kaynağı değiştir]- Holliday bağlantısında konformasyon değişimi16 Eylül 2009 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
- Tetrahedral şekilli Holliday bağlantı yapısı