Müze modern sanat (1905'ten 1960'a kadar) ve çağdaş sanat (1960'tan beri) koleksiyonuna sahiptir ve 1.000'den fazla eser içerir, ancak çağdaş sanat koleksiyonu ağırlıktadır. Eserlerin yaklaşık 800'ü resimlerden ve 200'ü heykellerden oluşur. Müzede bulunan eserler özellikle Azerbaycan'ın avangart akımını temsil ediyor ve Settar Behlülzade, Büyükağa Mirzezade, Elmira Şahtahtinskaya, Tahir Salahov, Ömer Eldarov, Nadir Abdurrahmanov, Eşref Murad, Fazıl Necefov, Mamed Mustafayev, Ali İbadullayev, Fuad Salayev, Ferhad Halilov, Darvin Velibekov, Eldar Memmedov, Mikail Abdurahmanov, Museib Amirov, Mahmud Rustamov, Hüseyin Hakverdi, Eliyar Alimirzayev, Reşid Babayev ve Altay Sadıkzade gibi bu tarzda çalışan Azerbaycanlı ressam ve heykeltıraşların eserleri sergilenmektedir. Yabancı ressam ve heykeltıraşlardan ise Salvador Dalí, Pablo Picasso ve Marc Chagall'ın eserleri sergilenmektedir.[1]
Bakü Modern Sanat Müzesi Koleksiyonu, başta resim ve heykel olmak üzere, enstalasyon, fotoğraf ve video gibi farklı disiplinlerden eserlere de ev sahipliği yapıyor.
